于1949年, 香港法医病理学服务先驱彭定祥医生(Dr PANG Teng-cheung）在警察总部建立了法医实验室, 并且被任命为香港第一位警察外科医生。在1956年他的职称被改为法医病理学家。他于1957年晋升为高级法医病理学家, 而于1961年正式地被任命为专家（法医病理学）。法医科在成立之初, 主要负责进行验尸和司法解剖。 随后法医科的工作范围逐渐拓展, 法医可能会就一些严重罪案对受害者和犯罪嫌疑人作临床检查和犯罪现场调查。1970年, 政府化验所科学鉴证部逐渐接管医学领域以外的法证工作。1981年, 法医科接管了当时医疗和卫生部辖下的两所公众殓房（即位于九龙红磡的九龙公众殓房和香港岛坚尼地城的维多利亚公众殓房）的管理和运营。而第三所公众殓房(即位于沙田的富山公众殓房)则于1989年落成及运营。至此, 香港岛、九龙及新界各有一所公众殓房为市民服务。2005年9月, 葵涌公众殓房替代九龙公众殓房服务市民。 而九龙公众殓房则停止日常运营, 并保留作应急用途。为满足日益增长的服务需求并提高卫生标准, 2018年法医科获批准就富山公众殓房作重新设计, 并且于邻近地点重置, 经过重新设计的新富山公众殓房位于新界（沙田）法医学大楼, 并在2022年12月开始运营。
2019年10月1日法医科改称法医服务。目前, 法医服务管理和运营着三所公众殓房 。 它们是专门的法医病理学设施, 用于对根据《死因裁判官条例》（第504章）进行法医病理学调查。 公众殓房的核心职能包括全天候接收「可报告给死因裁判官的死亡」的死者尸体和进行必要的死因裁判官程序, 涵盖对亲属的晤谈, 对尸体外部检查, 确认尸体身份, 进行尸体解剖, 以及协助亲属领回遗体。就2022年而言, 这三所公众殓房进行了13,728例尸体外部检查, 2,430例尸体解剖和33,378例组织学检查。2011年, 法医服务的三所公众殓房获得了有关运营质量管理的ISO 9001认证。
此外, 法医服务还设有三处法医病理学家办公室, 这些办公室位于警察场所内, 并配备了临床法医检查套件, 每年对受害者和犯罪嫌疑人（例如性犯罪）进行数百次临床法医检查。本服务还会为「免遣返声请」的声请者进行身体检查, 协助香港入境事务处审核免遣返声请。香港法医服务还包括向政府部门提供有关法医事务的专家意见, 包括死亡报告和针对警察案件的投诉, 勘验可疑死亡现场以及在法院提供专家证词。
一般大众对法医的惯常印象是他们依靠敏锐的观察和专业的解剖技巧来找出死亡原因以达至还原事件真相。但实际上, 他还利用其他病理学专业知识在不同领域进行深入的死亡调查。例如, 组织病理学通常用于寻找肉眼看不见的疾病过程或进一步确认肉眼检查的病理性质, 而法医毒理学和微生物学可用于鉴定可能导致或导致死亡的中毒和传染病。免疫学在包括过敏反应在内的严重过敏反应的诊断中也发挥了重要作用。
遗传和基因组病理学的进步也以“分子解剖”的形式在法医领域中得到应用。 例如, 患有先天性心律不齐的猝死者, 一般解剖和检测结果基本上俱为阴性。 而像布鲁加达综合症, 长QT综合症和儿茶酚胺能多态性心室性心动过速（CPVT）这类先天性心律不齐都可以通过分子遗传分析在验尸DNA中找出相关基因组。
在21世纪的法医学, 法医病理学家越来越多地使用放射学来补充甚至替代常规剖验。卫生署在重置富山公众殓房后, 为新殓房添置了计算机扫描（Computed Tomography, CT）系统。该系统容许在尸体解剖之前对身体内部进行初步观察,为法医提供线索, 使其在解剖身体之前已经清楚应该将注意力集中在何处。在某些情况下, 甚至可以通过识别导致死亡的病理而不用剖开身体, 减轻因个人或宗教原因而反对尸体解剖的家庭成员的痛苦。
法医病理学家在处理包括自然和人为灾难以及流行病在内的大规模死亡事件中起着关键作用。法医除了确定受害者的死亡原因外, 还为确定死者的身份和还原事件真相以及确保适当储存和处置尸体做出了重要贡献。在1996年的嘉利大厦五级大火中, 本服务的法医迅速完成了所有41名遇难者的解剖, 并联同警察和法医齿科医生, 成功地确认了所有遇难者的身份。
在2010年马尼拉人质事件之中, 有25名香港游客在马尼拉的圣地亚哥堡被一名持枪匪徒登上旅游巴士, 并强行扣为人质。 事件持续近10小时后，匪徒与特种武器和战术部队爆发枪战，事件最终引致8名香港游客死亡。事后, 香港卫生署法医服务一名法医被委派远赴马尼拉观察香港遇难者的解剖工作并记录调查结果。在遇难者遗体被送回香港之后, 法医们为尸体再次进行详细的解剖, 以重组子弹的弹道轨迹, 取出尸体内的子弹碎片, 并记录其他如玻璃碎片造成的伤害。科学鉴证专家和警察枪支专家进行的重建和模拟, 与解剖结果进行了比对, 有力地确定了所有死者体内的子弹碎片, 都是发射自匪徒所持有的枪支。
在2022年初的第五波2019冠状病毒病(COVID-19 disease)大流行中, 由于公立医院急诊室去世的患者人数突然激增, 急需公共殓房处理, 直接引致公众殓房系统不胜负荷。为应付紧急情况, 法医服务在沙田富山公众殓房附近建立了一个新的尸体贮存设施。同时, 本服务联同香港警务处以及食物环境卫生署, 进行了一项特别行动, 在大约2周内将1800多个死者遗体从各公立医院的急诊室移送至新增加的贮存设施。最后, 于2022年3月上旬, 在各部门的通力合作下将大约2700多个死者遗体移送至尸体贮存设施, 并存放在约60个大型冷冻货柜中。由于所有从急诊室转移的案件都属于「须予报告的死亡个案」的案件, 因此必须在既有司法程序底下进行彻底的死亡调查, 包括身份识别和亲属晤谈, 工作量非常浩大。有见及此, 本服务联同香港警务处和死因裁判法庭共同制定特定措施, 以便利家属辨认亲人遗体和加快家属对遗体的死后安排。在警察和死因裁判法庭的支持下, 本服务在2022年3月底至2022年4月上旬的两周内完成了1800多名死者的尸体识别并向死因裁判法庭呈交个案, 使到各家属都可以尽快为尸体进行葬礼安排。